Calculateur d'efficacité qPCR
Rédigé par Thierno Sadou Diallo, formule vérifiée selon notre méthodologie • Mis à jour le 16/08/2026
L'efficacité d'une qPCR se calcule avec E (%) = (10^(−1/pente) − 1) × 100. Une pente idéale de −3,32 donne une efficacité proche de 100 %, ce qui correspond à un doublement exact de l'ADN à chaque cycle d'amplification.
Explication
L'efficacité d'amplification est un contrôle qualité essentiel de toute expérience de PCR quantitative (qPCR) : elle mesure si la quantité d'ADN double bien à chaque cycle, l'hypothèse sur laquelle repose toute quantification relative ou absolue par cette technique. Elle se déduit de la pente de la courbe standard, obtenue en traçant le cycle seuil (Ct) mesuré pour une série de dilutions en fonction du logarithme en base 10 de leur concentration : plus l'ADN double efficacement à chaque cycle, plus cette pente se rapproche de la valeur théorique −3,32 (car log₁₀(2) ≈ 0,301, soit l'inverse de 3,32). La formule E = (10^(−1/pente) − 1) × 100 convertit cette pente en pourcentage directement interprétable. En pratique, une efficacité comprise entre 90 % et 110 % (pente entre environ −3,58 et −3,10) est généralement considérée comme acceptable pour la plupart des applications de qPCR ; en dehors de cette plage, la fiabilité de la quantification peut être compromise et il est recommandé de vérifier la qualité des amorces, la présence d'inhibiteurs ou la justesse des dilutions de la gamme standard. Une efficacité supérieure à 100 % n'indique pas une amplification "meilleure que parfaite", mais le plus souvent un artefact technique (pipetage imprécis de la gamme de dilution, présence de dimères d'amorces). Pour amplifier une cible avant d'en évaluer l'efficacité, voir notre calculateur d'amplification PCR ; pour quantifier la concentration d'ADN ou d'ARN de départ, notre calculateur de concentration d'acide nucléique.
Exemple : pente de courbe standard de −3,32
Données d'entrée
Pente : −3,32.
Calcul
Efficacité = (10^(−1 ÷ −3,32) − 1) × 100 = (10^0,301 − 1) × 100 ≈ (2,0007 − 1) × 100 ≈ 100,1 %.
Résultat
Cette pente correspond à une efficacité d'amplification d'environ 100 %, proche de l'idéal théorique.
Questions fréquentes
Pourquoi la pente idéale vaut-elle précisément −3,32 ?
Parce que log₁₀(2) ≈ 0,301, et que 1 ÷ 0,301 ≈ 3,32. Si la quantité d'ADN double exactement à chaque cycle (efficacité de 100 %), il faut environ 3,32 cycles supplémentaires pour compenser chaque dilution au dixième (facteur 10) de la gamme standard — d'où une pente théorique de −3,32 sur le graphique Ct en fonction du log₁₀ de la concentration.
Que faire si mon efficacité est en dehors de la plage 90-110 % ?
Vérifiez d'abord la justesse des dilutions en série de votre gamme standard (une erreur de pipetage systématique fausse directement la pente), la spécificité et la qualité des amorces (présence de dimères, mauvais appariement), et la présence éventuelle d'inhibiteurs de PCR dans l'échantillon. Une efficacité hors plage ne rend pas la qPCR inutilisable, mais impose de rester prudent sur l'interprétation quantitative des résultats, en particulier pour une quantification absolue.
Ce calcul remplace-t-il le coefficient de détermination (R²) de la courbe standard ?
Non, ce sont deux contrôles qualité complémentaires et distincts. La pente (et donc l'efficacité qu'elle donne) mesure la performance de l'amplification à chaque cycle ; le R² mesure la linéarité de la relation entre Ct et log₁₀(concentration), c'est-à-dire la fiabilité de la courbe elle-même sur toute la gamme de dilutions testée. Une bonne qPCR nécessite généralement une efficacité proche de 100 % et un R² proche de 1.