Calculateur d'indice de fixation (Fst)
Rédigé par Thierno Sadou Diallo, formule vérifiée selon notre méthodologie • Mis à jour le 05/09/2026
L'indice de fixation Fst se calcule avec (Ht − Hs) ÷ Ht, où Ht est l'hétérozygotie attendue dans la population totale et Hs la moyenne des hétérozygoties attendues dans chaque sous-population. Pour des fréquences alléliques de 0,2 et 0,8 dans deux populations, le Fst est de 0,36.
Explication
L'indice de fixation Fst, formalisé par le généticien Sewall Wright en 1943, mesure le degré de différenciation génétique entre deux populations ou plus, pour un même gène. Il compare l'hétérozygotie attendue si toutes les populations étaient fusionnées en une seule population totale (Ht) à la moyenne des hétérozygoties attendues à l'intérieur de chaque sous-population prise séparément (Hs) — l'hétérozygotie attendue étant elle-même calculée à partir des fréquences alléliques selon la loi de Hardy-Weinberg (2×p×(1−p) pour un locus à deux allèles), déjà couverte par notre calculateur de Hardy-Weinberg. Le résultat varie entre 0 (les deux populations ont exactement la même fréquence allélique : aucune différenciation, comme si elles n'en formaient qu'une seule) et 1 (chaque population est fixée pour un allèle différent : différenciation génétique totale, plus aucun échange génétique effectif entre elles). Un Fst intermédiaire, la situation la plus fréquente en pratique, reflète une différenciation partielle, généralement liée à un flux génétique limité entre les populations (isolement géographique, barrières reproductives) combiné à la dérive génétique ou à la sélection naturelle agissant différemment selon les environnements locaux. Ce calculateur traite le cas simplifié à deux populations et un seul locus bi-allélique ; l'analyse de plusieurs loci ou de plus de deux populations suit le même principe mais nécessite de moyenner ou de pondérer le résultat sur l'ensemble des loci et populations étudiés. Le Fst mesure la différenciation ENTRE des populations, un raisonnement complémentaire à celui du coefficient de consanguinité, qui mesure la parenté génétique DANS une population ou une lignée.
Exemple : fréquences alléliques de 0,2 et 0,8
Données d'entrée
Fréquence de l'allèle dans la population 1 : 0,2. Fréquence dans la population 2 : 0,8.
Calcul
H₁ = 2×0,2×0,8 = 0,32. H₂ = 2×0,8×0,2 = 0,32. Hs = (0,32+0,32)/2 = 0,32. Fréquence moyenne = (0,2+0,8)/2 = 0,5. Ht = 2×0,5×0,5 = 0,5. Fst = (0,5−0,32)/0,5 = 0,36.
Résultat
Ces deux populations affichent un Fst de 0,36, signe d'une différenciation génétique substantielle.
Questions fréquentes
Comment interpréter concrètement une valeur de Fst ?
En génétique des populations, on considère généralement qu'un Fst inférieur à 0,05 indique une différenciation faible, entre 0,05 et 0,15 une différenciation modérée, entre 0,15 et 0,25 une différenciation importante, et au-delà de 0,25 une différenciation très marquée entre les populations comparées — des repères indicatifs, pas des seuils universels rigides, qui varient selon les organismes étudiés et le contexte de l'étude.
Pourquoi le Fst est-il nul si les deux populations ont la même fréquence allélique ?
Parce que dans ce cas, l'hétérozygotie attendue à l'intérieur de chaque sous-population (Hs) est exactement égale à l'hétérozygotie attendue si l'on fusionnait toutes les populations en une seule (Ht) : subdiviser la population en groupes n'a alors aucun effet sur la répartition génétique observée, puisque chaque groupe est déjà représentatif de l'ensemble.
Ce calculateur fonctionne-t-il pour plus de deux populations ou plusieurs gènes ?
Ce calculateur traite le cas simplifié à deux populations et un seul locus à deux allèles, le cas pédagogique et introductif le plus courant. Pour plus de deux populations, Hs et Ht se calculent en moyennant sur l'ensemble des populations plutôt que sur deux seulement ; pour plusieurs loci, le Fst global se calcule généralement en moyennant les Fst individuels de chaque locus, éventuellement pondérés par leur variance.