Calculateur de dissimilarité de Bray-Curtis
Rédigé par Thierno Sadou Diallo, formule vérifiée selon notre méthodologie • Mis à jour le 06/09/2026
La dissimilarité de Bray-Curtis se calcule avec 1 − (2 × somme des minimums partagés) ÷ (somme des effectifs des deux échantillons). Elle varie de 0 (échantillons identiques en abondance) à 1 (aucune abondance partagée).
Explication
Contrairement à l'indice de Jaccard et à l'indice de Sørensen-Dice, qui ne considèrent que la PRÉSENCE ou l'ABSENCE d'une espèce dans chaque échantillon, la dissimilarité de Bray-Curtis prend en compte l'ABONDANCE relative de chaque espèce — un critère souvent plus informatif en écologie quantitative. Le calcul additionne, espèce par espèce, le minimum des deux effectifs (la part réellement « partagée » entre les deux échantillons), puis compare cette somme au total combiné des deux échantillons. Une conséquence importante de cette différence : deux échantillons qui contiennent exactement les mêmes espèces, mais dans des proportions très différentes (une espèce dominante dans l'un, rare dans l'autre, et inversement), obtiennent un indice de Jaccard parfait de 1 (les mêmes espèces sont présentes dans les deux), alors que leur dissimilarité de Bray-Curtis reste élevée, révélant une structure de communauté très différente que les indices de présence/absence ne peuvent pas détecter. C'est pourquoi Bray-Curtis est largement utilisé en écologie des communautés pour comparer des relevés de végétation, de macro-invertébrés ou de communautés microbiennes, où l'abondance relative porte une information écologique importante que la seule liste d'espèces présentes ne capture pas.
Exemple : deux échantillons partageant 3 espèces en proportions différentes
Données d'entrée
Échantillon A : espèces à 10, 20 et 0 individus. Échantillon B : espèces à 8, 15 et 5 individus.
Calcul
Minimums partagés = min(10,8) + min(20,15) + min(0,5) = 8 + 15 + 0 = 23. Total combiné = (10+20+0) + (8+15+5) = 30 + 28 = 58. Dissimilarité = 1 − (2 × 23 ÷ 58) = 1 − 0,793 ≈ 0,207.
Résultat
La dissimilarité de Bray-Curtis entre ces deux échantillons est d'environ 0,21, soit environ 79 % de similarité.
Questions fréquentes
Pourquoi deux échantillons avec les mêmes espèces peuvent-ils avoir une forte dissimilarité de Bray-Curtis ?
Parce que Bray-Curtis mesure la similarité des ABONDANCES, pas seulement de la liste d'espèces présentes. Deux échantillons contenant les 3 mêmes espèces, mais où l'une domine largement dans le premier échantillon et une autre domine dans le second, ont une structure de communauté très différente sur le plan écologique, même si leur composition en espèces (présence/absence) est identique — une nuance que seul un indice basé sur l'abondance peut révéler.
Que représentent les emplacements d'espèces laissés à zéro ?
Un effectif de zéro pour une espèce donnée signifie simplement que cette espèce est absente de cet échantillon, ce qui reste une information valide pour le calcul (elle contribue 0 au minimum partagé pour cette espèce). Ce calculateur accepte jusqu'à 5 espèces au total entre les deux échantillons ; laissez à 0 les emplacements non utilisés.
Bray-Curtis est-il une vraie distance mathématique ?
Pas au sens strict : Bray-Curtis ne respecte pas l'inégalité triangulaire dans tous les cas, ce qui en fait techniquement un indice de dissimilarité plutôt qu'une distance mathématique à part entière. Cela n'empêche pas son utilisation très répandue en écologie des communautés, où son interprétation intuitive (une proportion de dissimilarité entre 0 et 1) prime sur cette subtilité mathématique.