Calculateur de nombre de copies de plasmide
Rédigé par Thierno Sadou Diallo, formule vérifiée selon notre méthodologie • Mis à jour le 08/09/2026
Le nombre de copies de plasmide se calcule avec (masse en g ÷ (taille en pb × 660)) × nombre d'Avogadro. Pour 250 ng d'ADN d'un plasmide de 3000 pb, cela représente environ 7,6 × 10^10 copies.
Explication
Connaître le nombre de copies exact d'ADN plasmidique dans un échantillon est essentiel pour préparer des standards de calibration en PCR quantitative (qPCR), où la quantification d'un échantillon inconnu repose sur la comparaison à une gamme de dilutions de concentration en copies connue. Le calcul part de la masse molaire de l'ADN double brin, approximée à 660 grammes par mole pour chaque paire de bases (une valeur qui tient compte des deux brins complémentaires de la double hélice) : multiplier cette masse molaire par la taille du plasmide en paires de bases donne la masse molaire totale de la molécule. Diviser la masse d'ADN mesurée (convertie en grammes) par cette masse molaire donne le nombre de moles présentes, qu'il suffit alors de multiplier par le nombre d'Avogadro (6,022 × 10^23, le nombre de molécules dans une mole) pour obtenir le nombre de copies. Ce calcul suppose un ADN plasmidique pur, sans contamination par d'autres acides nucléiques (ADN génomique, ARN) qui fausserait la mesure de masse totale utilisée dans le calcul ; une vérification de la pureté de l'échantillon (par exemple via notre calculateur de concentration d'acide nucléique) reste une étape préalable recommandée avant d'utiliser ce résultat pour une calibration précise.
Exemple : 250 ng d'ADN, plasmide de 3000 pb
Données d'entrée
Masse d'ADN : 250 ng. Taille du plasmide : 3000 pb.
Calcul
Masse molaire = 3000 × 660 = 1 980 000 g/mol. Moles = (250 × 10⁻⁹) ÷ 1 980 000 ≈ 1,26 × 10⁻¹³ mol. Copies = 1,26 × 10⁻¹³ × 6,022 × 10²³ ≈ 7,6 × 10^10.
Résultat
Cette masse d'ADN plasmidique représente environ 7,6 × 10^10 copies.
Questions fréquentes
Pourquoi utiliser 660 g/mol par paire de bases plutôt qu'une autre valeur ?
Cette valeur représente la masse molaire moyenne d'une paire de bases d'ADN double brin, calculée à partir de la composition moyenne des quatre bases azotées (adénine, thymine, guanine, cytosine) et de leur appariement complémentaire dans la double hélice. C'est la valeur la plus largement citée et utilisée par les outils de calcul de biologie moléculaire, bien qu'elle reste une moyenne : la composition exacte en bases GC d'un plasmide spécifique peut légèrement faire varier sa masse molaire réelle par rapport à cette approximation standard.
Ce calcul fonctionne-t-il aussi pour de l'ADN linéaire ou de l'ARN ?
Le même principe de calcul s'applique à de l'ADN linéaire (un fragment de PCR, par exemple), la constante de 660 g/mol par paire de bases restant valable pour tout ADN double brin quelle que soit sa conformation. L'ARN simple brin a en revanche une masse molaire par base légèrement différente (généralement autour de 320-330 g/mol par nucléotide), ce qui demande une constante distincte non couverte par ce calculateur.
Pourquoi vérifier la pureté de l'échantillon avant d'utiliser ce calcul ?
Parce que ce calcul suppose que toute la masse d'ADN mesurée correspond au plasmide d'intérêt : une contamination par de l'ADN génomique résiduel, de l'ARN, ou des protéines fausserait la masse totale utilisée dans le calcul et donnerait un nombre de copies erroné. Une mesure de pureté (ratio d'absorbance 260/280, par exemple) avant ce calcul permet de s'assurer que le résultat reflète bien le plasmide seul, tout comme notre calculateur de concentration protéique par courbe d'étalonnage aide à quantifier une éventuelle contamination protéique.